Après une série de tribulations, un vagabond s’introduit dans la tour d’un maître alchimiste. Ce dernier lui fait parcourir les premières étapes d’une initiation, puis lui présente sept personnes qui…
Hors-la-loi, El Topo défie pour l’amour d’une femme les Quatre Maîtres du Désert. Les ayant vaincus, sa conscience s’élève jusqu’à ce que sa femme le trahisse. Sa nouvelle vie d’homme…