Scooby-Doo et la bande prennent part à une parade des Fêtes dans laquelle ils découvrent une tour surmontée d’une horloge au passé troublant, qui semble abandonnée et hantée.

Sept ans après Racoon City, alors que Claire Redfield est de passage dans l’aéroport d’Harvardville, ce dernier est contaminé par le Virus-T. Elle parvient à se réfugier avec quelques survivants…

En 2113, la Terre, paisible, est envahie par une autre planète appelée Elysium. Quatre guerriers ont le destin de la race humaine entre leurs mains. Van, Christopher, Paul et Nyx…