Un an après les événements survenus dans Galaxy Express 999, Tetsuro, toujours en compagnie de Maetel, reprennent la route en direction de la planète Eternal.

Après la mort de sa mère, Katsumi veut quitter au plus vite Tokyo. Forcée de rester, Katsumi est furieuse. D’un côté l’AMP demande à ce qu’elle les rejoigne, de l’autre…

Dans un Tokyo futuriste, des policières combattent un monstre. L’une d’entre elles, Katsumi Liqueur, se souvient de l’endroit où elle l’a déjà vu…

Akira Fudô, un timide étudiant, se voit contacter par son ami Ryô dans l’urgence. Celui-ci lui révèle que les démons, endormis depuis des lustres, sont à présent prêts à récupérer…

Une princesse transylvanienne, un étudiant et un guerrier vieux de 2000 ans sont choisis pour faire partie d’une troupe de combattants créée afin de stopper une entité extra-terrestre résolue à…

Suite à sa victoire face à la reine Promethium, Tetsurô décide finalement de rentrer sur Terre. Cependant, la ville qu’il chérissait tant, Metropolis, a été détruite par les sbires de…

Les aventures d’un petit garçon qui voyage de planète en planète à bord d’un train, le Galaxy Express 999, dans le but de venger la mort de sa mère.